Kluczowym elementem systemu laboratoryjnego ProfLab jest szybki i prosty w obsłudze panel konfiguracyjny. Administrator systemu ma dostęp do zintegrowanego konfiguratora badań, w którym uzyskuje dostęp do zmian ustawień. Umożliwia to tworzenie oraz modyfikowanie badań, jak również konfigurację ich parametrów i norm. Dzięki walidacji norm użytkownik ma pewność, iż wprowadzona konfiguracja jest spójna oraz nie zawiera podstawowych błędów.